El origen de este Santuario está relacionado con una leyenda muy bonita, aunque difícil de creer, escrita por Fray Miguel de Varona en el año 1715.

Se construyó en el año 1300, en tiempos del séptimo señor de Varona. Dependía de Valpuesta hasta el año 1167.  En ese mismo año, se construyó un hospital junto al Santuario. Y junto a ellos, se reunían las Juntas de Hijosdalgo de la zona.

La espadaña que se encuentra cerca del Santuario procede del pueblo de Villamardones. El retablo mayor es renacentista.