Este pequeño pueblo, apenas conocido, fue un núcleo importante en tiempos remotos. De hecho, su Iglesia de Santo Tomás se quedó pequeña y construyeron la actual sobre una anterior del siglo XVI

Pertenece a Mendieta la Casa de los Ayala, construida en el siglo XVIII, que se encuentra enfrente del Santuario de La Encina y que marcaba los límites entre Arceniega y las tierras de Ayala. Otra prueba de la importancia de esta localidad es la maravillosa Torre de Mendieta, con sus tres pisos y escudo de armas en la fachada, reformada en el siglo XVI sobre otra Casa-fuerte anterior.

Este pueblo ha sido testigo de varias luchas banderizas y en sus campos han muerto varios de sus personajes ilustres. Entre ellos, Gabriel de Orúe, que tenía su Casa armera, con los escudos episcopales. O José de Lanzagorta Salazar y Velasco, que fundó la capilla del Rosario, en 1742.